1.学习方式不同
自考是采取自学为主、社会助学为辅的教育形式。需要注意的是，自考就是自学考试，不能称之为全日制。如果普通专升本考试成功，会被本科院校所录取，想要获得学历和学位证书，必须经过长达2年的全日制学习。
2.报名条件不同
专升本必须在专科学校大三的时候报考，而且每一位学生只有1次考试的机会;自学考试需要专科的学历，每年都有2次报名机会。也就是说，在校的专科生不仅可以选择参加专升本考试，也可以参加自学考试，但是如果你只有自学考试的身份则无法报考专升本考试。
3.毕业文凭不同
统招专升本考试是高等院校根据国家招生计划，组织优秀专科生在专科学习阶段的第三学年参加全省教育厅高教处统一组织的招生考试，录取后再进入全日制普通高校就读二年，毕业后发全日制普通高校专升本二年制本科毕业文凭。
自考专升本是专科毕业后，离开学校后或工作一段时间，参加全国统一的自学考试，每年按照所报考的学校和专业不同，每年1,4,7,10月参加考试，全部考试通过后，学位英语完成，论文达标，最后颁发的学历是自考本科学历。毕业证盖所学习高校章，证书上显示“高等教育自学考试”字样。
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